汽车空调长期使用后，外界的混浊空气就会经过管道堆积在空调滤清器或蒸发器上。长时间灰尘、杂物的累积，一来会堵死部分进气通道，使出风口出风量下降，造成凉度不够，影响制冷质量；二来还会损害驾乘者的健康。
由于汽车长期在户外奔跑，因此空调一年至少要清洗３次。空调清洗其实很简单，不用拆装空调系统，只要用专用的空调清洗剂清洗蒸发器和进、出风口之间的风道就可以了。一般清洗时间在半个小时左右，费用在５０元以内。
另外提醒车主汽车空调清洗千万不要把空调系统拆开，因为这样很容易引起汽车空调系统损坏，导致漏氨，免拆装清洗一定要采用中性的专用清洗剂，否则可能会腐蚀空调系统的零件；并且整个操作过程必须有经过专业培训的人员进行，才能在保障健康的同时，也保证爱车的空调不受损坏。
除了清洗以外，还有一个重要的因素就是消毒。您可知道在打开空调的同时，各种有害气体也会趁机而动。因为空调蒸发箱和通风管道的潮湿环境及表面的灰尘，为霉菌和真菌的滋生提供了温床，霉菌和真菌会很快繁衍为霉菌团和真菌团，产生生物体腐烂性异味。这些异味会随着空调的打开，夹杂在冷气当中，污染整个车厢内部，因此一定要定期对汽车空调进行消毒。
对空调进行消毒时，首先要将车内的物品取出，避免吸附异味，然后将空调定在外循环档上，注入空调清洗剂，让风扇持续转动10至15分钟。之后将汽车的灰尘滤清器取下，再将空调定在内循环档上，同时把清洗剂喷到灰尘滤清器处。这样，各种细菌与污物就会随着排水管流出车外，从而达到清洁消毒的作用。